科学大修是指对已发表的科学论文进行重要修订和补充的过程。它通常发生在原始论文中的一些错误或遗漏被发现，或者在进一步的实验和研究中获得了新的结果和发现。有时候，根据特定期刊的规定，科学大修可能需要更正作者名单或添加新的作者。但是，是否可以将第二作者列为科学大修后的新作者是一个有争议的问题。

首先，科学大修是为了修正和完善原始论文的错误和不足之处。因此，仅仅进行科学大修并不足以获得第二作者的资格。通常情况下，只有对原始论文做出具有独立贡献的人才能够列为第二作者。他们的贡献应该在修订期间或后续的实验和研究中对论文的重要性有直接影响。

其次，科学大修后的论文通常被视为原始论文的修正版。在修订过程中，除了作者署名的问题外，通常其他方面如实保持不变，如引用的文献和实验方法等。因此，如果第二作者没有参与对原始论文的贡献，将其列为修订后的论文的作者可能会对其他人的贡献产生误导。

然而，特定学术期刊可能会允许在一些情况下修改作者名单。例如，如果科学大修会导致对原始论文的主要结论进行实质性更改，或者科学大修需要进行大规模的实验和数据分析，而这些工作正是由第二作者完成的，那么将其列为修订后的论文的第二作者可能是合理的。此外，对于某些需要在作者名单中进行大规模更改的学科领域（如大型合作项目和实验），科学大修后涉及作者名单的修改也是可能的。

总之，一般而言，将第二作者列为科学大修后的论文的作者是有争议的。除非第二作者对修订过程或后续的实验和研究做出了实质性的独立贡献，否则应该保持原始论文的作者名单不变。然而，在某些特定情况下，根据期刊的规定和特殊要求，适度地进行作者名单的修改也是可以考虑的。在任何情况下，确保作者名单的准确和透明是科学研究道德的重要方面，应该以诚实和慎重的态度对待。